Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SQSTM1Q13501 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SQSTM1Q13501 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SQSTM1Q13501 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SQSTM1Q13501 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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