Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMED1Q13445 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMED1Q13445 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.3 ms