Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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