Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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EXT1Q16394 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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