Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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FOXQ1Q9C009 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXQ1Q9C009 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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