Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
BCANQ96GW7 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BCANQ96GW7 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BCANQ96GW7 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BCANQ96GW7 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BCANQ96GW7 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BCANQ96GW7 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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