Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RASGEF1AQ8N9B8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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