Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDB1Q16531 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDB1Q16531 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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