Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNN3Q15417 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNN3Q15417 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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