Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNFAIP1Q13829 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.7 ms