Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PDE3BQ13370 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PDE3BQ13370 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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