Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX13Q9Y5W8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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SNX13Q9Y5W8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SNX13Q9Y5W8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNX13Q9Y5W8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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