Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC74AQ96AQ1 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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