Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VPS72Q15906 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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