Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VAMP3Q15836 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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