Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ITSN1Q15811 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ITSN1Q15811 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms