Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNN3Q15417 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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