Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMED1Q13445 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMED1Q13445 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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