Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1Q9UJ41 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1Q9UJ41 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.1 ms