Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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