Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPS72Q15906 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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