Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNN3Q15417 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNN3Q15417 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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