Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMC1AQ14683 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMC1AQ14683 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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