Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNF235Q14590 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNF235Q14590 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms