Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNFAIP1Q13829 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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