Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIK3Q13003 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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