Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRTO14522 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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