Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VN1R3Q9BXE9 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VN1R3Q9BXE9 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.9 ms