Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SCN9AQ15858 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SCN9AQ15858 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SCN9AQ15858 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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