Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SURF1Q15526 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SURF1Q15526 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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