Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTF1Q15361 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TTF1Q15361 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TTF1Q15361 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.2 ms