Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PDE3BQ13370 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE3BQ13370 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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