Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRTO14522 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRTO14522 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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