Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SNX13Q9Y5W8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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SNX13Q9Y5W8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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