Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRRTQ9BXP5 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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