Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRIM63Q969Q1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRIM63Q969Q1 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRIM63Q969Q1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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