Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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USP53Q70EK8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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USP53Q70EK8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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USP53Q70EK8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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USP53Q70EK8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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USP53Q70EK8 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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