Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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USP49Q70CQ1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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USP49Q70CQ1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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USP49Q70CQ1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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USP49Q70CQ1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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USP49Q70CQ1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP49Q70CQ1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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