Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ECM1Q16610 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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