Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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SGCBQ16585 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SGCBQ16585 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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