Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
DDX39BQ13838 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
DDX39BQ13838 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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