Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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