Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNTA1Q13424 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNTA1Q13424 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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