Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXD4Q12950 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXD4Q12950 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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