Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRAP18433 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTPRAP18433 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTPRAP18433 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPRAP18433 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
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PTPRAP18433 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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