Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HPF1Q9NWY4 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms