Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TTC9Q92623 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TTC9Q92623 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.9 ms