Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Q6P435 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Q6P435 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Q6P435 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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