Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCBQ16585 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCBQ16585 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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