Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23BQ15437 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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